接下来进入学术讨论阶段，王凡、侯泉林和苏刚分别作了题为《热带太平洋海洋环流与暖池的结构特征、变异机理和气候效应》、《深部煤矿瓦斯突出与超量煤层气赋存机理问题》和《未来能源的挑战》的学术报告，引发在座学者的关注和讨论。

17日下午的专题报告会议由石耀霖主持。马瑾、刘嘉麒、莫宣学、金振民、陈晓非、高锐、陈永顺依次登台作报告。每场报告结束后，专家学者都进行了热烈的讨论。

茶歇过后，地学院教授章文波、魏东平、吴春明、孙文科等作了相关学术报告；实验室副主任张怀教授对“实验室科学计算环境建设”作了报告，彰显了实验室的雄厚实力和科研贡献。

18日，60余名师生按照专业方向分为“固体地球与地球动力学”、“地质物性与地球动力学”两个专题同时进行学术报告。讲演精彩，讨论热烈，学术氛围浓厚。会议由始至终井然有序，程序规范，气氛活跃。下午18时，为期两天的“计算地球动力学重点实验室2012年学术年会”圆满闭幕。